研究院将着眼于建设中国（福建）自由贸易试验区这一重大国家战略，发挥福建师范大学在经济、金融、工商管理等方面的优势，整合校内外科研力量，建成跨学科、跨区域、综合性的高水平智库，成为培养和培训适应福建自贸区发展需要的专门人才的重要基地。研究院首任院长由首批国家“万人计划”青年拔尖人才入选者、福建师范大学经济学院教授黄茂兴担任。

　　研究院下设国际贸易与投资规则研究中心、金融开放创新研究中心、税收与公共服务研究中心、现代物流与电子商务发展研究中心、企业发展战略研究中心、知识产权保护与法律规制研究中心、人才保障研究中心、绩效评估研究中心等研究平台，将重点开展自贸区的贸易与投资、自贸区的金融与资本深化、自贸区的产业发展与技术创新、自贸区的国际人才培养与发展、自贸区的知识产权保护与法律规制等前沿性、战略性问题研究，并积极承担对自贸区各类人才的培训任务。

　　研究院将实行开放的办院思路，采取“政产学研”合作的协同创新模式，广泛联合国内外相关领域科研院所、政府机构、企业、著名高校及国际组织的研究人员，深入开展自贸区发展的理论、政策和实践问题研究，为福建自贸区建设和发展提供理论和思想支持，成为助力福建自贸区建设与发展的思想库、信息库、人才库。研究院将定期向政府部门和企业报送研究报告，编辑《福建自贸区通讯》，出版《福建自贸区蓝皮书》，并举办福建自贸区发展高峰论坛。（杨舒）