随后几年，他先后获得湖泊生态学、微生物学两个博士学位。10多年来发表80多篇学术论文，被同行引用2800余次，应邀在国内外做了10多场学术报告，并获得了国家杰出青年基金的支持，帮助地湖所的湖泊微生物生态学研究水平与国际同行保持一致。

　　野外科研一待就是一两周甚至两个月，通过跟踪调查蓝藻水华，了解其发生的原因、机制

　　大规模的取样调查，是开展湖泊微生物资源的保护与可持续利用的基础。西藏湖泊众多，吴庆龙前后去过7次。

　　白雪皑皑的唐古拉山下，蔚蓝色的湖泊倒映着蓝天白云雪山，在阳光下闪烁着璀璨光芒。2005年夏天，吴庆龙来这里考察。“当时在海拔5200米左右的一个山口，汽车开不进去，但考虑到这是一个冰川补给的高原低温湖泊，有不可替代的价值，也就顾不得徒步的危险了。”吴庆龙和一位同事拎着取样器就出发了。然而，由于大气通透度高，看似就在眼前的湖泊走了一个半小时还没到达，很快便体力不支。在取样返回的路上，吴庆龙和同事每走五到十步就眼前一黑，需要停下来大喘几口气，几斤重的取样器和两桶水更像有千斤重。

　　辛勤付出换来了丰硕成果。

　　他通过研究发现，西藏湖泊的浮游细菌对紫外辐射具有耐受性，有着独特的微生物区系和科研价值，为了解湖泊微生物形成机制及规律提供了重要的科学参考；通过对蓝藻水华的跟踪调查，了解到其发生的原因、机制，揭示湖泊蓝藻水华暴发对湖泊生态系统以及人体健康的影响，为湖泊蓝藻水华灾害的控制、湖泊生态恢复打下坚实基础。

　　从上世纪90年代初，吴庆龙便开始关注太湖蓝藻，有一次他在湖心取样，船底突然开裂灌水。吴庆龙拿起取样器不断往外舀水，近一个小时才被路过的大船救起……在野外科研，他一待就是一两周甚至一两个月，每日在水面上工作数小时，冬天饥寒交迫、夏天酷暑难耐，这些都如同家常便饭。

　　2008年到2012年间，吴庆龙担任国家重点基础研究发展计划（973计划）“湖泊蓝藻水华生态灾害形成机理及防治的基础研究”项目首席科学家。经过长期研究，他认为，治理太湖蓝藻，当前的关键任务，一是严格控制入湖水的磷排放，二是建立预警系统，避免出现蓝藻水华暴发导致的次生环境灾害。据此，他提出的相应建议被各级政府所采纳，为蓝藻水华防治提供了科学依据。

　　提出利用植物和微生物的相互作用净化水质，扭转抚仙湖水质恶化趋势

　　“作为生态科学家，最终目标还是要服务于湖泊保护。”吴庆龙说。

　　在我国最大的深水湖——云南的高原湖泊抚仙湖，自2003年开始，吴庆龙就参与到保护抚仙湖的科研中。2014年以来，他不仅在中科院支持下建设了抚仙湖高原深水湖泊研究站，而且曾在云南玉溪市抚仙湖管理局任挂职副局长和党组成员，致力于抚仙湖的生态环境保护。

　　“抚仙湖保护的核心工作之一，就是构建环抚仙湖湿地生态系统，通过植物和微生物的相互作用，利用湿地净化入湖的有机物质、氮、磷等。湿地微生物是降解有机物和脱氮的主要驱动者。”吴庆龙介绍，这一方案使抚仙湖一度出现恶化趋势的水质发生转变，经过十多年努力，抚仙湖水质总体保持在地表Ⅰ类水标准。（姚雪青）